“If you have references in markup, they will not be renamed”

ASP.NET sitesindeki herhangi bir bileşenin adını değiştirmeye kalkınca böyle bir uyarı alıyorsanız, cache'i temizlemeniz sorunu çözecektir.

Tüm cache'i temizlemek yerine sadece web site instance'larını kaldırmak için:

1- VS .Net'i kapatın.

2- cmd ile command penceresini açın ve şu komutu yazın:
rd /s /q "%userprofile%\Local Settings\Application Data\Microsoft\WebsiteCache"

3- Web sitesini tekrar açtığınızda cache yeniden oluşturulacak, böylece artık bu hatayı almayacaksınız.